科学家们对此进行了不断探索,认为贝加尔湖以前是“北方的海洋”,以后发生地 壳运动,周围高山隆起,它却相对下降,形成了湖泊.以后,周围众多的河流流入湖泊,渐渐地冲淡湖水,使之成为淡水湖,结束了它作为海洋的历史.原来大多数生活在海洋中的海洋生物,在贝加尔湖变迁为淡水湖的过程中绝灭.但是,有些生存能力特强的动物,慢慢地适应了淡水环境,成为世界上特有的淡水动物,如贝加尔海豹等.
也有学者认为,贝加尔湖中的淡水类海洋动物,原先生活在海洋中,以后不安于海洋生活,进入叶尼塞河,并不断地向河流上游运动,最终到达贝加尔湖,逐渐习惯了在淡水中生活,繁衍后代,便形成了在淡水湖中的“海洋动物”.