Juhn,clean your room,______?A will you B shall we C don't you D doesn't you 请问是为什么、

这是祈使句,一般除了let's 开头的祈使句用 shall we?反问,其他都用will you.
参考
与祈使句有关的反意疑问句
（1）以表示建议的肯定祈使句开头的反意疑问句,其疑问部分通常为will you,也可以是won’t you,我们可以把该祈使句转换成一个表示委婉建议的疑问句来考虑.例如：
Please turn down the radio,will / won’t you?
Wait for a moment,will / won’t you?
(2) 以否定祈使句开头的反意疑问句,其疑问部分为will you.例如：
Please don’t draw on the wall,will you?（思路同上.）
(3) 以Let’s开头,表示建议的祈使句,由于句中的主语实际上包括听、说双方,所以其疑问部分为shall / shan’t we.例如：
Let’s have a rest,shall / shan’t we?
如果是由Let’s not开头的祈使句,其疑问部分用all right或O.K..例如：
Let’s not go shopping,all right / OK?
(4) 以Let us / me开头,征询意见的祈使句,由于句中的主语实际上仅指对方,所以其疑问部分为will you.例如：
Let us go there,will you
Let me have another try,will you?